Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip13Q3UA06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip13Q3UA06 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 363.3 ms