Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cops9Q3U898 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops9Q3U898 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops9Q3U898 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cops9Q3U898 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cops9Q3U898 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops9Q3U898 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Cops9Q3U898 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cops9Q3U898 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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