Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp6Q3U6U5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp6Q3U6U5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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