Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmf1Q3U3R4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmf1Q3U3R4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms