Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Serac1Q3U213 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serac1Q3U213 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Serac1Q3U213 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms