Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hace1Q3U0D9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hace1Q3U0D9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms