Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt1Q3TX08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trmt1Q3TX08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms