Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Calr4Q3TQS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Calr4Q3TQS0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Calr4Q3TQS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms