Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afvQ3THW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afvQ3THW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afvQ3THW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms