Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3KNL4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3KNL4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3KNL4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3KNL4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3KNL4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms