Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Col24a1Q30D77 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col24a1Q30D77 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col24a1Q30D77 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col24a1Q30D77 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.7 ms