Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd163Q2VLH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd163Q2VLH6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd163Q2VLH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms