Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Edem3Q2HXL6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Edem3Q2HXL6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Edem3Q2HXL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms