Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300lgQ1ERP8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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