Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc39dQ0VF76 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc39dQ0VF76 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc39dQ0VF76 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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