Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb8Q0VBD0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb8Q0VBD0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms