Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lrriq1Q0P5X1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lrriq1Q0P5X1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms