Protein–RNA interactions for Protein: Q0P521

1700013D24Rik, MCG1037134, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013D24RikQ0P521 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700013D24RikQ0P521 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700013D24RikQ0P521 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700013D24RikQ0P521 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700013D24RikQ0P521 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700013D24RikQ0P521 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700013D24RikQ0P521 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700013D24RikQ0P521 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms