Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnnm1Q0GA42 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cnnm1Q0GA42 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnnm1Q0GA42 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms