Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q08AU9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q08AU9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q08AU9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q08AU9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q08AU9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q08AU9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q08AU9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q08AU9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q08AU9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q08AU9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q08AU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q08AU9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q08AU9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q08AU9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q08AU9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q08AU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q08AU9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q08AU9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q08AU9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q08AU9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q08AU9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q08AU9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q08AU9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q08AU9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q08AU9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q08AU9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q08AU9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q08AU9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q08AU9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q08AU9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q08AU9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms