Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp2Q08652 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp2Q08652 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms