Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LyarQ08288 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LyarQ08288 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LyarQ08288 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LyarQ08288 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LyarQ08288 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LyarQ08288 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LyarQ08288 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LyarQ08288 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms