Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrstQ06666 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrstQ06666 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrstQ06666 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrstQ06666 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrstQ06666 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms