Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk18Q04899 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms