Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox13Q04891 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox13Q04891 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox13Q04891 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms