Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelbQ04863 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RelbQ04863 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelbQ04863 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelbQ04863 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RelbQ04863 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms