Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msx2Q03358 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msx2Q03358 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms