Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mmp11Q02853 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp11Q02853 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp11Q02853 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms