Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nhlh1Q02576 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms