Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkcqQ02111 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkcqQ02111 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkcqQ02111 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms