Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly9Q01965 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly9Q01965 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly9Q01965 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly9Q01965 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms