Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RykQ01887 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RykQ01887 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RykQ01887 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RykQ01887 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RykQ01887 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RykQ01887 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RykQ01887 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RykQ01887 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RykQ01887 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RykQ01887 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RykQ01887 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RykQ01887 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RykQ01887 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RykQ01887 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RykQ01887 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RykQ01887 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RykQ01887 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RykQ01887 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RykQ01887 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RykQ01887 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RykQ01887 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RykQ01887 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RykQ01887 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RykQ01887 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms