Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cacna1cQ01815 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1cQ01815 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1cQ01815 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms