Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme2Q01768 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms