Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp1Q01514 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp1Q01514 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp1Q01514 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms