Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23aQ01405 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sec23aQ01405 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec23aQ01405 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec23aQ01405 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms