Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HmgcrQ01237 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HmgcrQ01237 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmgcrQ01237 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HmgcrQ01237 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms