Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja5Q01231 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja5Q01231 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gja5Q01231 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja5Q01231 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms