Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col1a2Q01149 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col1a2Q01149 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col1a2Q01149 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms