Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pde1bQ01065 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde1bQ01065 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde1bQ01065 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms