Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms