Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GabpaQ00422 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GabpaQ00422 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GabpaQ00422 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms