Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabpb1Q00420 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb1Q00420 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb1Q00420 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms