Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scn1bP97952 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn1bP97952 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn1bP97952 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms