Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smn1P97801 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smn1P97801 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smn1P97801 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smn1P97801 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms