Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarcc1P97496 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcc1P97496 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms