Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad4P97471 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad4P97471 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad4P97471 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad4P97471 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad4P97471 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad4P97471 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad4P97471 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms