Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smyd1P97443 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd1P97443 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd1P97443 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms