Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Meis3P97368 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Meis3P97368 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Meis3P97368 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Meis3P97368 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis3P97368 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Meis3P97368 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms