Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf1bP97358 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf1bP97358 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms